替え玉君はページの一部分のみを難読化するということはできませんが、iframeを用いれば疑似的に部分の難読化が可能です。

例えば、このページ本体は替え玉君を使用していないので難読化されていませんが、下にある俳句の部分は、 iframeを使用して難読化されたHTMLページを表示しています。このようにしてページの一部分のみを疑似的に難読化することができます。